Türkiye, DMP ve deniz çevresinin korunması konularında çeşitli bölgesel ve uluslararası çerçeveler aracılığıyla sınır ötesi iş birliğine aktif olarak katılmaktadır. Akdeniz için Birlik (UfM) üyesi olarak Türkiye, Akdeniz’de sürdürülebilirlik, biyolojik çeşitliliğin korunması ve kirliliğin kontrolü konularında iş birliği yapmaktadır. Ayrıca, deniz kirliliğinin azaltılması ve kıyı ekosistemlerinin korunmasına yönelik bölgesel çabalarla uyumu sağlayan Barselona Sözleşmesi’ne taraftır. Karadeniz’de ise Türkiye, Bükreş Sözleşmesi çerçevesinde komşu ülkelerle iş birliği yaparak kirlilikle mücadele, biyolojik çeşitliliğin korunması ve sürdürülebilir kaynak yönetimi konularında çalışmalar yürütmektedir. Bununla birlikte, Türkiye, Avrupa Çok Disiplinli Deniz Tabanı ve Su Kolonu Gözlemevi (EMSO) kapsamında sınır ötesi bilimsel araştırmalara, veri paylaşımına ve deniz çevresinin izlenmesine katkıda bulunmaktadır.